Чтобы уточнить платеж по налогу, подайте заявление в инспекцию по месту учета. К заявлению приложите платежное поручение, подтверждающее, что налог в бюджет перечислен. После этого инспекция составит уведомление об уточнении платежа и направит его в свое казначейство. Оттуда сообщение поступит в казначейство региона, куда ошибочно поступил ваш платеж. Когда деньги найдутся, налоговики отразят их в карточке учета компании.

Если у вас есть личный кабинет на сайте ФНС, то зачисление денег можно проверить там. Или же пройдите сверку с инспекцией.

Подробнее: http://www.glavbukh.ru